Após a drenagem do abcesso, o principal risco é o aparecimento de fístula perianal que pode ocorrer em 50% dos doentes drenados. O doentes que desenvolvem uma fístula têm de ser adequadamente tratados, porque o risco de novos abcessos é muito alto. No entanto, nos doentes que cicatrizaram completamente após a drenagem do abcesso, o risco de recidiva é baixo (inferior a 5%).
A recidiva frequente de abcessos perianais implica investigar outras doenças que possam estar a manifestar-se com a formação de novos abcessos na região do ânus. As doenças que habitualmente levam à recidiva são a doença de Crohn, a tuberculose, a hidrosadenite supurativa e em casos raros a neoplasia perianal. Estas doenças têm de ser tratadas para diminuir o risco de formação de abcessos.
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